杭州病原微生物宏基因组 mNGS 检测
临床应用
快速识别细菌/真菌/病毒/寄生虫等病原体,适用于重症感染、不明原因发热、免疫缺陷患者感染、ICU 复杂感染
样本类型
血液/痰液/肺泡灌洗液/脑脊液/尿液/分泌物
检测方法
宏基因组高通量测序
报告周期
3天
价格
3500元元
适用人群
从家族遗传与感染易感性角度切入,通过宏基因组测序覆盖31,033种病原体,帮助遗传咨询中评估家族聚集性感染风险及不明原因发热的病因。
适用人群
- 有家族聚集性感染病史,需评估遗传易感性与病原体关联的家庭成员
- 遗传咨询中疑似免疫缺陷基因携带者,伴反复或重症感染
- 家族中连续多代出现不明原因发热或难治性感染的患者
- 遗传性免疫调节异常(如家族性噬血细胞综合征)患者的感染鉴别
- 接受基因检测后需验证感染病因的遗传咨询案例
- 家族中存在罕见病原体感染(如分枝杆菌、真菌)的成员筛查
检测内容
本检测采用宏基因组高通量测序(mNGS),对临床样本中所有微生物核酸进行无偏倚测序,覆盖31,033种微生物,包括细菌14,208种(含104种分枝杆菌)、真菌814种、病毒15,720种(DNA病毒12,894种+RNA病毒2,826种)、寄生虫169种、支原体/衣原体97种、螺旋体25种。同时检测4,417种耐药基因(覆盖31种抗生素)和484种毒力基因。在遗传咨询场景中,可识别家族性感染中潜在的病原体,区分定植与致病,但无法直接检测宿主遗传变异,需结合遗传学结果综合解读。样本类型包括血液、痰液、肺泡灌洗液、脑脊液、尿液、分泌物等,报告周期为3天。
检测流程
采样便捷,无需空腹。根据感染部位选择样本类型:血液2-5mL、痰液、肺泡灌洗液或脑脊液3-5mL、尿液10-20mL、分泌物拭子。本地医院或诊所可完成采样,样本常温邮寄至实验室,确保24小时内送达。遗传咨询师或医生可直接开具检测,无需特殊准备。本检测适用于重症、ICU或复杂感染场景,常规门诊可配合采血流程。
准确性说明
检测基于ABX指南和临床微生物学手册(第11版)判读,采用DNA+RNA同时测序,灵敏度高,能检出丰度低至痕量的病原体。阳性结果需结合临床:高reads病原体直接对应治疗;中等reads病原体需综合临床症状确认;低reads可能为定植或污染,需谨慎评估。阴性结果不能完全排除感染,可能因采样不当、抗生素使用或新发病原体。耐药基因检测指导抗生素选择,但需药敏试验验证。安全性高,仅需常规采血或体液采集。
详细流程
- 遗传咨询师或医生评估患者家族史与感染特征
- 开具检测申请单,选择合适样本类型(血液/痰液/肺泡灌洗液/脑脊液/尿液/分泌物)
- 在杭州本地医院或诊所完成样本采集,标记后密封
- 样本常温邮寄至实验室,确保24小时内到达
- 实验室进行前处理、核酸提取(DNA+RNA)、cDNA合成、文库构建
- 高通量测序,比对31,033种微生物数据库及4,417种耐药基因
- 生物信息分析,结合质控与阴性质控样本扣除背景
- 3天内出具报告,由遗传咨询师或临床医生解读,指导治疗
检测流程
咨询预约
确定检测方案
样本采集
到场或邮寄
实验室检测
专业分析
报告出具
专业解读
常见问题
- 我最近在工地受伤,伤口接触了泥土,现在红肿发热,担心是破伤风或特殊细菌感染,能查吗?
- 可以。本检测覆盖14,208种细菌(包括破伤风梭菌等厌氧菌)及真菌、寄生虫,能检测常见和罕见病原体。同时检测4,417种耐药基因,帮助指导抗生素选择。但需注意,破伤风诊断主要依据临床和病史,mNGS结果需结合伤口培养综合判断。
- 我在杭州的医院,医生怀疑我得了结核性脑膜炎,但脑脊液涂片和培养都是阴性,能用这个查吗?
- 可以。结核分枝杆菌属于难培养病原,常规方法阳性率很低。本检测采用宏基因组测序,不依赖培养,数据库中明确包含104种分枝杆菌(含结核分枝杆菌),能直接检测脑脊液样本中的病原体DNA/RNA,24-48小时即可出结果,非常适合您这种疑难中枢神经系统感染的鉴别。
- 检测结果里说的‘reads’是什么意思?读数高低怎么判断?
- “reads”是测序过程中产生的DNA或RNA片段读数,代表该病原体在样本中的相对丰度。一般来说,同一病原体的reads数越高,提示其存在的可能性越大;低reads(如<10)需谨慎判读,可能是污染或定植。但部分胞内菌或RNA病毒天然reads较低,需结合临床症状综合评估。
- 报告说检出‘α乳头瘤病毒7型’,这个和宫颈癌有关吗?
- α乳头瘤病毒7型是皮肤型HPV,主要引起寻常疣、趾疣、扁平疣等皮肤良性增生,与宫颈癌无关。检测覆盖15,720种病毒,此型并非高危黏膜型HPV。若皮肤无疣体,可能为携带或取样污染,无需特殊处理,请皮肤科医生评估。
- 我在杭州,怎么获取专用采样管?
- 您可联系我们的客服人员,提供您的城市和地址信息,我们会安排将专用采样包(含采样管、冰袋、运输箱、填写单)快递到您手上。采样包免费提供,您只需支付检测费用。收到后按说明书采样,并尽快联系快递上门取件寄回实验室即可。
注意事项
- 本检测不能替代常规培养或药敏试验,需结合临床综合判断
- 结果可能检出定植菌或实验室污染,需专业解读
- 样本采集后需尽快送检,避免核酸降解影响检出率
- 抗生素使用后可能降低病原体核酸量,影响阳性率
- 本检测不直接评估宿主遗传变异,需与遗传检测结果联合分析
- 报告周期为3天,重症急诊可咨询加急流程
- 部分罕见或新发病原体可能不在数据库中,存在漏检可能
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